Con carácter general, el plazo de prescripción de las obligaciones tributarias es de cuatro años. Durante este periodo, la Administración tributaria puede ejercer sus facultades de comprobación y liquidación. No obstante, existen determinadas situaciones especiales en las que los plazos de revisión o conservación de la documentación pueden ampliarse.
Entre los principales supuestos que deben tenerse en cuenta se encuentran los siguientes:
- Bases imponibles negativas compensadas: cuando una empresa declara pérdidas en un ejercicio y las compensa en ejercicios posteriores, la Administración tributaria dispone de un plazo de diez años para comprobar dichas bases, conforme a las reglas legalmente establecidas.
- Deducciones fiscales pendientes de aplicación: cuando una empresa genera una deducción que no aplica en el ejercicio correspondiente, Hacienda dispone de diez años para comprobar su procedencia.
- Cuotas de IVA o del Impuesto sobre Sociedades compensadas: se trata de cuotas fiscales que se trasladan de un ejercicio a otro y que pueden requerir la conservación de documentación justificativa.
En los supuestos sujetos a un plazo especial de comprobación de diez años, resulta fundamental conservar la documentación que permita acreditar las operaciones y los importes declarados.
Importante: Aunque el plazo general de prescripción tributaria es de cuatro años, existen derechos de comprobación específicos que pueden extenderse durante diez años, como ocurre con determinadas bases imponibles negativas y deducciones fiscales.
Interrupción de la prescripción por actuación de Hacienda
El plazo general de cuatro años puede interrumpirse cuando la Agencia Tributaria realiza determinadas actuaciones de comprobación o inspección que cumplen los requisitos legalmente establecidos.
Por ejemplo, si Hacienda inicia en septiembre de 2025 una actuación de revisión sobre una liquidación de IVA correspondiente al cuarto trimestre de 2023, dicha actuación puede interrumpir la prescripción y dar lugar al inicio de un nuevo plazo.
En determinadas circunstancias, las irregularidades detectadas durante una comprobación también pueden tener consecuencias sobre otros impuestos relacionados.
Esto puede suceder cuando, durante una inspección del Impuesto sobre Sociedades, se identifican gastos que no son fiscalmente deducibles y la Administración considera necesario examinar también su tratamiento a efectos del IVA.
Atención: No cualquier comunicación de Hacienda interrumpe automáticamente la prescripción. La actuación debe cumplir los requisitos previstos en la Ley General Tributaria y referirse al derecho u obligación correspondiente.
Interrupción de la prescripción por parte de la empresa
Las propias empresas y contribuyentes también pueden realizar actuaciones que interrumpan el plazo de prescripción de determinadas obligaciones tributarias.
Entre ellas se encuentran la presentación de declaraciones complementarias, las solicitudes de rectificación de autoliquidaciones y la interposición de reclamaciones o recursos administrativos relacionados con un tributo.
En cada caso será necesario analizar qué derecho resulta afectado y cuáles son los efectos de la actuación sobre el cómputo del plazo.
Por otra parte, en materia de prevención del blanqueo de capitales, la Ley 10/2010 establece obligaciones específicas de conservación documental durante diez años para los sujetos obligados, conforme a las condiciones previstas en dicha normativa.
Plazos de prescripción y conservación más habituales
A continuación, se resumen los principales plazos de conservación documental que las empresas deben tener presentes en su gestión fiscal, contable y administrativa.
| Tipo de documentación |
Plazo general |
| Libros, justificantes del negocio mercantil y correspondencia |
6 años |
| Facturas y documentación fiscal en general |
4 años |
| Documentación relativa a deducciones y bases imponibles negativas |
10 años de comprobación específica, sin perjuicio de obligaciones posteriores de acreditación |
| Documentación vinculada a la prevención del blanqueo de capitales |
10 años |
| Documentación vinculada a la Seguridad Social y al ámbito laboral |
4 años, con las excepciones que correspondan |
Por tanto, como criterio general de prudencia, puede establecerse un plazo de conservación de seis años para la documentación empresarial, ampliándolo a diez años o al periodo superior que corresponda en determinados supuestos.
Cuando existan diferentes obligaciones legales de conservación, deberá tenerse en cuenta el plazo aplicable a cada documento y la posible existencia de procedimientos o comprobaciones pendientes.
Aspecto destacado: El plazo de prescripción tributaria y el plazo de conservación documental no siempre coinciden. Antes de eliminar documentación, es necesario comprobar todas las obligaciones legales aplicables.
Recomendaciones para conservar la documentación
Muchas empresas optan por destruir los documentos físicos cuando ya disponen de copias digitalizadas. Sin embargo, antes de hacerlo, conviene comprobar que los archivos electrónicos cumplen las condiciones necesarias de autenticidad, integridad, legibilidad y trazabilidad.
Es recomendable establecer protocolos internos de conservación documental para evitar problemas en caso de inspección o requerimiento de la Administración.
Entre las principales medidas que pueden adoptarse destacan las siguientes:
- Identificar los plazos de conservación aplicables a cada tipo de documentación.
- Aplicar el plazo legal más amplio cuando concurran varias obligaciones de conservación.
- Garantizar que los documentos digitalizados puedan utilizarse como prueba ante la Administración.
- Establecer procedimientos internos para autorizar la destrucción de documentos.
- Conservar los certificados o justificantes correspondientes cuando se realice una destrucción documental.
Una gestión adecuada de los archivos fiscales y contables facilita la defensa de los intereses de la empresa ante posibles comprobaciones tributarias.
Conclusión
Resulta aconsejable que las empresas establezcan protocolos generales de conservación documental, conocidos por todos los departamentos implicados.
Asimismo, cualquier destrucción de documentación debería contar con la revisión y autorización previa de la persona responsable de esta área.
La falta de justificantes puede generar dificultades durante una inspección tributaria e incluso dar lugar a consecuencias económicas desfavorables.
Por ello, ante cualquier duda sobre los plazos de prescripción de las obligaciones tributarias o la conservación de documentación, resulta preferible adoptar un criterio de prudencia y contar con asesoramiento profesional.
Asesoramiento fiscal y contable
Una correcta gestión de los plazos de prescripción y de la documentación tributaria permite reducir riesgos y disponer de los justificantes necesarios ante posibles actuaciones de comprobación de la Agencia Tributaria.